Gustaf Sjökvist är sedan 1967 verksam i Storkyrkan i Stockholm som domkyrkoorganist med ansvar för kyrkans kör- och konsertverksamhet. Mellan 1986-1994 var han chefdirigent och konstnärlig ledare för Radiokören. 1994 grundade Gustaf Sjökvist den kammarkör som bär hans namn, en ensemble vars repertoar till stor del kommit att innehålla nutida musik. Sedan 1994 är han förste gästdirigent hos Radiokören vid Bayerischer Rundfunk i München. Han är dessutom en ofta sedd gäst vid orkestrar i Skandinavien, Tyskland och England. 1988 utnämndes han till ledamot av den Kungl. Musikaliska Akademien och tilldelades 1991 professorstitel av den svenska regeringen. 1998 blev han tilldelad Litteris et Artibus. Dessutom blev han utnämnd till Hovorganist år 2000.